Управление школой осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации, Уставом Школы и строится на принципах единоначалия и самоуправления.
Непосредственное управление МБУ ДО "Спортивная школа №3". осуществляет прошедший соответствующую аттестацию директор – Кузнецова Евгения Николаевна.
Основными формами самоуправления являются педагогический совет, тренерский совет, Совет школы и общее собрание работников Школы. Порядок работы коллегиальных органов определяется соответственно Положением о педагогическом совете, Положением о тренерском совете.

В школе работает  3 отделения: самбо, дзюдо, бокс.